หลังจากที่สงครามโลกครั้งที่สี่ของชิโนบิสิ้นสุดลงอย่างประสบความสำเร็จ โคโนฮะงาคุเระก็ได้เพลิดเพลินไปกับช่วงเวลาแห่งสันติภาพ ความเจริญรุ่งเรือง และความก้าวหน้าทางเทคโนโลยีที่ไม่ธรรมดา ทั้งหมดนี้เป็นผลมาจากความพยายามของกองกำลังชิโนบิของฝ่ายสัมพันธมิตรและโฮคาเงะรุ่นที่เจ็ดของหมู่บ้าน นารูโตะ อุซึมากิ ในปัจจุบัน โคโนฮะงาคุเระได้เปลี่ยนไปราวกับมหานครสมัยใหม่ โดยเฉพาะชีวิตของชิโนบิ ภายใต้การจับตามองของนารูโตะและสหายเก่าของเขา ชิโนบิรุ่นใหม่ได้ก้าวขึ้นมาเพื่อเรียนรู้วิถีของนินจา
โบรูโตะ อุซึมากิ มักจะเป็นจุดสนใจในฐานะลูกชายของโฮคาเงะรุ่นที่เจ็ด แม้จะสืบทอดนิสัยห้าวหาญและดื้อรั้นของนารูโตะมา แต่โบรูโตะก็ถือเป็นอัจฉริยะและสามารถปลดปล่อยศักยภาพของตัวเองได้ด้วยความช่วยเหลือจากเพื่อนๆ และครอบครัวที่คอยสนับสนุน น่าเสียดายที่สิ่งนี้กลับทำให้ความเย่อหยิ่งของเขาและความปรารถนาที่จะเหนือกว่านารูโตะแย่ลงไปอีก ซึ่งเมื่อรวมกับวิถีชีวิตที่ยุ่งวุ่นวายของพ่อของเขาแล้ว ความสัมพันธ์ของพวกเขาก็ตึงเครียดขึ้น อย่างไรก็ตาม พลังชั่วร้ายที่ก่อตัวขึ้นภายในหมู่บ้านอาจคุกคามชีวิตที่ไร้กังวลของโบรูโตะได้
เพื่อนใหม่และใบหน้าที่คุ้นเคยเข้าร่วมกับโบรูโตะในเรื่องราวใหม่เริ่มต้นขึ้น
