ในปีพ.ศ. 2466 วิกฤตแวมไพร์เข้ายึดครองกรุงโตเกียว เกิดจากการค้า “แอสครา” อย่างผิดกฎหมาย แหล่งเลือดเทียมทำให้จำนวนแวมไพร์เริ่มเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วภายในเมือง ภายใต้คำสั่งของพลโทโซโนะสึเกะ นากาจิมะ หน่วยรบพิเศษที่ 16 รวบรวมแวมไพร์ในกองทัพเพื่อจัดตั้งหน่วยล่าแวมไพร์สายลับที่รู้จักกันในชื่อโค้ดซีโร่
ผู้นำหน่วยคือพันเอก โยชิโนบุ มาเอดะ เขามีหน้าที่รับผิดชอบในการค้นหาแหล่งที่มาของการค้า Ascra รวมถึงการจับกุมและสังหารแวมไพร์ โดยเขาถูกกดดันให้ผลิตผลลัพธ์อันมีประโยชน์ท่ามกลางเสียงวิพากษ์วิจารณ์ที่เพิ่มมากขึ้นซึ่งคุกคามที่จะปลดประจำการหน่วยนี้ ที่ทำให้สถานการณ์เลวร้ายลงไปอีกก็คือ เหล่าแวมไพร์ภายในหน่วยกำลังดิ้นรนที่จะเข้าใจพลังและตัวตนที่เพิ่งได้รับใหม่ของพวกเขา เนื่องจากตอนนี้พวกเขาไม่ใช่มนุษย์อีกต่อไป เมื่อโลกกำลังขัดแย้งกับพวกเขา สมาชิกของ Code Zero จะต้องหาวิธีควบคุมวิกฤตนี้ มิฉะนั้นก็จะตกเป็นเหยื่อของสัญชาตญาณปีศาจของตนเอง
