หลังจากเดินทางไกลจากโลกไปหลายปีแสง ยานอวกาศ Macross ก็พาพลเรือนและทหารกลับบ้าน พวกเขาต่อสู้กับภัยคุกคามจาก Zentradi และ Meltrandi ซึ่งเป็นเผ่าพันธุ์ต่างดาวขนาดยักษ์ที่มนุษย์ก่อสงครามด้วยอยู่ตลอดเวลา
ระหว่างการต่อสู้ Macross ได้แปลงร่างเป็นหุ่นยนต์ที่ควบคุมโดยนักบินขับไล่ Hikaru Ichijou หลังจากเผชิญกับความยากลำบากมากมาย Hikaru จึงสนิทสนมกับ Minmay Lynn ซึ่งเป็นไอดอลของเมืองมากขึ้น อย่างไรก็ตาม เมื่อความสัมพันธ์ของพวกเขาพัฒนาไป ผู้คนอื่นๆ กลับมองความสัมพันธ์นี้ในแง่ลบเนื่องจากสถานะและความนิยมของ Minmay
ในขณะที่สงครามยังคงดำเนินต่อไปและโลกยังไม่เป็นที่รู้จัก Hikaru และเพื่อนทหารของเขาต่อสู้กับศัตรูลึกลับของพวกเขาต่อไป ตลอดการนองเลือด Hikaru และ Minmay พยายามรักษาความรู้สึกที่มีต่อกัน Minmay ทุ่มเททั้งหัวใจให้กับดนตรีของเธอ ซึ่งอาจกลายเป็นกุญแจสำคัญในการค้นหาความสงบสุข
