จะเกิดอะไรขึ้นเมื่อคนสองคนรักกันแต่ก็ไม่ได้ถูกสร้างมาเพื่อคู่กัน? ทาคากิ โทโนะ และอาคาริ ชิโนฮาระเป็นเพื่อนสมัยเด็ก แต่สถานการณ์ที่ไม่อาจควบคุมได้ทำให้พวกเขาต้องแยกทางกัน พวกเขาสัญญาว่าจะยังคงติดต่อกัน และถึงแม้กาลเวลาจะผ่านไป ระยะห่างระหว่างพวกเขาก็ยิ่งกว้างขึ้น แต่ห่วงโซ่แห่งความทรงจำยังคงอยู่ตลอดไป
Byousoku 5 Centimeter เป็นละครโรแมนติกที่มุ่งเน้นไปที่ความเป็นจริงอันน่าเบื่อและโหดร้ายของความสัมพันธ์ระยะไกล ติดอยู่ในอดีตและไม่สามารถสร้างความทรงจำใหม่ได้ ทาคากิและอาคาริจึงยึดมั่นกับความหวังที่จะได้พบกันอีกครั้ง พวกเขาใช้ชีวิตประจำวันอย่างไม่เต็มที่ ทำร้ายตัวเองและคนรอบข้าง