ในปี 2071 มนุษยชาติถูกผลักดันให้เกือบสูญพันธุ์หลังจากการปรากฏตัวของสัตว์ประหลาดกินคนที่เรียกว่า “อารากามิ” ที่มีภูมิคุ้มกันต่ออาวุธทั่วไป พวกมันทำลายล้างผืนดิน กลืนกินแทบทุกอย่างที่ขวางหน้าและไม่ทิ้งร่องรอยไว้ เพื่อต่อสู้กับพวกมัน องค์กรที่ชื่อเฟนริลจึงถูกก่อตั้งขึ้นเป็นความพยายามครั้งสุดท้ายในการช่วยมนุษยชาติโดยใช้ “ผู้กินพระเจ้า” ซึ่งเป็นมนุษย์พิเศษที่ถูกฝังเซลล์ออราเคิล ทำให้พวกเขาสามารถถือครองก๊อดอาร์ค ซึ่งเป็นอาวุธชนิดเดียวที่มีความสามารถในการฆ่าอารากามิได้ หนึ่งในผู้กินพระเจ้าดังกล่าวคือเลนกะ อุสึกิ ซึ่งเป็นมนุษย์ประเภทใหม่ที่มีก๊อดอาร์คที่สามารถแปลงร่างเป็นทั้งดาบและปืนได้
ขณะนี้ เนื่องจากเลนกะเป็นหนึ่งในอาวุธที่ยิ่งใหญ่ที่สุดในบรรดาอาวุธเฟนริล เขาจึงต้องเชี่ยวชาญก๊อดอาร์คของเขาหากต้องการสนองความปรารถนาในการกำจัดอารากามิให้สิ้นซาก เหล่าสัตว์ประหลาดยังคงถือกำเนิดขึ้นเป็นจำนวนมากในขณะที่มนุษย์ที่เหลือรอดต้องดิ้นรนเอาชีวิตรอดในคืนนั้น มีเพียง God Eaters เท่านั้นที่ยืนหยัดระหว่าง Aragami และการทำลายล้างเผ่าพันธุ์มนุษย์ให้สิ้นซาก
