นักเรียนชั้น 3-E จากโรงเรียนมัธยมคุนุกิโอกะอันทรงเกียรติกลับมาจากวันหยุดฤดูร้อนและพบว่าพวกเขาต้องเผชิญกับอุปสรรคที่ยากจะเอาชนะได้ เมื่อเผชิญกับความเป็นไปได้ที่โลกจะล่มสลาย นักเรียนจะต้องคิดหาวิธีที่สร้างสรรค์และซับซ้อนมากขึ้นเรื่อยๆ เพื่อฆ่าอาจารย์ของพวกเขา อาจารย์โคโระเซ็นเซที่เจ้าเล่ห์แต่ก็มองโลกในแง่ดีและชอบช่วยเหลือ
ผู้อื่น อย่างไรก็ตาม การกำจัดอาจารย์โคโระเซ็นเซไม่ใช่เป้าหมายเดียวที่นักเรียนต้องกังวล กาคุโฮ อาซาโนะ ผู้อำนวยการโรงเรียนที่ไร้ความปราณีและโหดร้ายพยายามขัดขวางความสำเร็จของนักเรียนชั้น 3-E ด้วยการล้างสมองนักเรียนที่ทำงานหนักคนอื่นๆ ของเขาให้กลายเป็นเครื่องจักรการเรียนรู้ที่แข่งขันกันอย่างโหดร้าย ความเป็นปฏิปักษ์เริ่มแผ่กระจายในอากาศเมื่อทั้งผู้ทรยศและฆาตกรพยายามเรียกร้องค่าหัวของอาจารย์โคโระเซ็นเซเป็นของตนเอง
นางิสะ ชิโอตะ หนึ่งในนักฆ่าฝีมือดีที่สุดของชั้น 3-E พบว่าตัวเองอยู่ท่ามกลางความขัดแย้ง ขณะที่เขาพยายามรักษาสถานะทางวิชาการของตนและป้องกันไม่ให้โลกแตกสลาย กิจการภายในก็กำลังคุกคามตำแหน่งของเขาในชั้น 3-E เขาต้องเผชิญหน้ากับภัยคุกคามอย่างตรงไปตรงมาร่วมกับเพื่อนร่วมชั้นที่ทุ่มเท
